Krei realiza un evento en el edificio de su compañía, donde llega Callaghan y comienza a atacar con los microbots.

Luego recrea el portal, que lentamente destruye el edificio de Krei.

Los héroes llegan a tiempo para defenderse. Callaghan usa los microbots para atacar a los amigos de Hiro, mientras que Hiro es expulsado de Baymax y casi es succionado por el portal. Él consigue que sus amigos vean esto desde otro lado.

Los cuatro usan sus armas para liberarse de los microbots. Baymax entonces salva a Hiro. Hiro les dice que envíen microbots a través del portal para que Callaghan no tenga nada que usar contra ellos. Lo logran y dejan a Callaghan sin nada. Él casi es arrastrado al portal, pero Baymax lo agarra.

El portal cae al suelo y todavía está activo. Baymax dice que detecta una forma de vida que proviene del portal, y es una mujer en hipersueño. Abigail todavía está viva, y Hiro monta a Baymax y va a través del portal para rescatarla.

Encuentran su cápsula en medio de los restos del edificio de Krei, y la empujan hacia el portal. Sin embargo, un pedazo gigantesco de escombros golpea la armadura de Baymax, dejándolo con solo la mitad. Sus propulsores de cohete están caídos, y él sabe que no puede sacarlos a todos.

Baymax le dice a Hiro que puede enviarlo a él y a Abigail. Hiro no quiere perder a Baymax, pero este le asegura que todo estará bien. Hiro le abraza con lágrimas en los ojos.

Baymax lanza el puño en forma de cohete para empujar a Hiro y Abigail a través del portal, mientras que Baymax se aleja.

Hiro y Abigail llevan justo antes de que el portal explote. Abigail se despierta y es llevada al hospital, mientras Callaghan es arrestado. Él mira con vergüenza, sabiendo que tal vez nunca vuelva a ver a su hija.

La ciudad reconoce el heroísmo de la pandilla, sin darse cuenta de su verdadera identidad. Go Go, Wasabi, Honey y Fred pasan el rato en el café de Cass con Hiro.

En su habitación, Hiro pone el puño del cohete hacia abajo, cuando se abre y revela que el chip de atención médica todavía está en su lugar. Utilizando esto, Hiro reconstruye Baymax tal como lo hizo Tadashi. Los dos se abrazan.

Hiro cierra la película con una voz en off diciendo que tal como Tadashi quería ayudar a la gente, ahora él y sus amigos van a hacer lo mismo.

Se reúnen en sus trajes, junto con Baymax, para entrar en acción como... ¡BIG HERO 6!

Después de los créditos: se muestra a Fred en su casa mirando un retrato familiar. Se dirige a su padre y dice que desearía haber podido ser mejor. Luego toca el retrato, que abre una habitación secreta con artilugios y trajes. Detrás de él, aparece su padre (¡ES Stan Lee!)

Encuentra unos calzoncillos de spandex. Comparten el mismo método de uso de la ropa interior (frente, atrás, adentro hacia afuera, luego de adelante hacia atrás). Los dos se abrazan, y el padre de Fred dice que tienen mucho que hacer para ponerse al día.