Tras la mastectomía de su esposa Theresa, Nathan Gardner traslada a su familia, incluidos los niños Lavinia, Benny y Jack, a la granja de su difunto padre. Una noche, un meteorito brillante se estrella en su patio delantero, traumatizando brevemente a Jack. A la mañana siguiente, el hidrólogo Ward Phillips, que está estudiando la zona para la construcción de una presa, junto con el alcalde y el sheriff de la cercana ciudad de Arkham, llegan para ver el meteoro. Esa noche, durante una tormenta, Nathan y Lavinia son testigos de cómo el meteoro es alcanzado por numerosos rayos.

Ward se da cuenta de que el agua subterránea ha adquirido un brillo aceitoso y la analiza. Cuando sus tiras reactivas empiezan a brillar con el color, aconseja a los Gardner que no la beban. Mientras notifica a Ezra, un residente cercano, de la contaminación, se le muestra una grabación de sonidos de origen desconocido que suenan debajo de la casa de Ezra por la noche. Mientras tanto, Jack se obsesiona con el pozo de la propiedad, observando extraños crecimientos de plantas e insectos, además de afirmar que se comunica con un "amigo" dentro del pozo. Un equipo de noticias llega para entrevistar a Nathan sobre el meteorito, pero descubre que ha desaparecido.

Más tarde, mientras Theresa prepara la cena, se corta distraídamente dos dedos. Mientras Nathan la lleva al hospital, deja a Benny a cargo. A petición de Nathan, Benny sale para devolver las alpacas de la granja a sus establos, pero no regresa hasta bien entrada la noche, alegando que el tiempo ha pasado instantáneamente para él. Mientras tanto, Lavinia intenta varias veces ponerse en contacto con Nathan, pero no consiguen escucharse a través del teléfono. A la vuelta de los padres, Nathan arremete contra Benny y Lavinia con una rabia inusitada.

Más tarde, Nathan se frustra al comprobar que su última cosecha de frutas no es comestible, y Theresa estalla tras perder a un cliente de su trabajo por culpa de una conexión a Internet que falla, lo que lleva a los dos a pelearse. Esa misma noche, Lavinia intenta realizar un Ritual utilizando el Necronomicón y ofreciendo su sangre para salvar a su familia, mutilándose en el proceso. De repente, Theresa oye los gritos de Jack y Benny después de entrar en los establos de las alpacas y se apresura a socorrerlos, pero en el proceso, un rayo de Color funde a Theresa y Jack en una masa desquiciada. Al no poder arrancar el coche ni pedir ayuda porque todos los dispositivos electrónicos han dejado de funcionar, y al descubrir que la luz del sol daña a Theresa y Jack, Nathan y los niños los llevan al ático. Benny revela que ha visto a las alpacas tras una horrible mutación debida al color. Nathan decide aplicar la eutanasia a las alpacas con una escopeta tras comprobar que se han fusionado de forma similar. Empezando a perder la cordura, Nathan también intenta aplicar la eutanasia a Theresa y Jack, pero es incapaz de hacerlo.

Lavinia y Benny conspiran para salir de la granja utilizando el caballo de Lavinia, pero éste huye de la propiedad. Antes de volver al interior, Benny insiste en que oye al perro de la familia dentro del pozo, pero al subir, es asimilado por el Color. Nathan muestra más rabia inusual y encierra a Lavinia en el ático con Theresa y Jack, que se han vuelto agresivos. Ward y el sheriff acuden a la granja después de que un residente cercano descubra una masa fundida de animales, y llegan justo a tiempo para irrumpir en el ático. Nathan dispara y mata al monstruo, salvando a Lavinia.

Después de salir corriendo, Nathan intenta disparar al Color que sale del pozo, pero el sheriff confunde la puntería de Nathan con la de Ward y le dispara fatalmente. Ward y el sheriff salen para evacuar a Ezra, y Lavinia insiste en quedarse con Nathan. En la casa de Ezra, la pareja sólo encuentra su cadáver disecado y una grabación que dejó, donde conjetura que el Color está intentando rehacer la Tierra en "algo que conoce". Al regresar a la granja, un árbol vivo mutado mata al sheriff.

Ward vuelve para rescatar a Lavinia, pero la encuentra poseída por el Color, que explota fuera del pozo y forma un embudo en el cielo. Antes de que Lavinia se desintegre, Ward tiene una visión de la procedencia del Color, un exoplaneta psicodélico habitado por entidades alienígenas con tentáculos. Mientras el espacio y el tiempo comienzan a desintegrarse, Ward entra en la granja y es perseguido por una aparición asesina de Nathan. Se esconde en la bodega mientras la distorsión de la realidad por parte del Color lleva a la propiedad a la destrucción, dejando a Ward como único superviviente al salir de los restos de la granja, que ahora es un "páramo maldito" incoloro y ceniciento.

En un epílogo, un traumatizado Ward se encuentra en la cima de la presa terminada que cubre la antigua propiedad, y narra que habiendo sido testigo de la toma de posesión del Color, nunca beberá el agua de la presa.