El industrial español convertido en anarquista Xavier Heimdahl se las arregla para que su socio Jan Strook -un hacker conocido como "el Holandés"- cree un programa de agujero de gusano que permitiría a su propietario saltarse todos los códigos informáticos que protegen los códigos de defensa nuclear del mundo. El holandés entra en pánico e intenta entregar su secreto al agente de la CIA Bill Pope. Aunque Pope consigue llevar al Holandés a un piso franco y recuperar el dinero para pagarle por sus servicios, es capturado por los hombres de Heimdahl y torturado hasta la muerte antes de que pueda decir a nadie dónde escondió al Holandés.

Desesperado por encontrar al Holandés, el supervisor de Pope, Quaker Wells, se pone en contacto con el Dr. Micah Franks, que ha desarrollado un tratamiento que, en teoría, podría implantar los patrones de memoria de una persona muerta en una viva. Franks les pide que "injerten" los conocimientos de Pope en el cerebro del convicto Jerico Stewart, que recibió daños en el lóbulo frontal al sufrir abusos de niño y es, en la práctica, un sociópata.

Tras la operación, Jerico se fuga y finge su muerte. Roba una furgoneta de mantenimiento y se dirige a casa de Pope, donde retiene como rehén a Jillian, la viuda de Pope, mientras busca el dinero. A medida que pasa el tiempo, experimenta flashes de recuerdos del pasado de Pope, pero lo único que puede determinar es que la bolsa de dinero estaba escondida detrás de una estantería, sin identificar dónde está guardada ni el Holandés.

La CIA se entera de que el Holandés planea vender el programa a los rusos, creyendo que la CIA le ha traicionado. Afortunadamente, consiguen encontrar a Jerico después de que éste se ponga en contacto con el Dr. Franks para pedirle medicación utilizando los códigos de Pope de la CIA. Jerico empieza a desarrollar emociones y a recurrir a la experiencia de Pope. Mientras Jerico intenta desandar el camino que Pope siguió para esconder al Holandés, Heimdahl crea una distracción en el aeropuerto que atrae la atención de Wells, lo que permite a Elsa, cómplice y amante de Heimdahl, intentar capturar a Jerico, matando a sus guardias de la CIA antes de que Jerico escape tirando un taxi por un puente.

Jerico se retira a la casa de Pope, donde se encuentra con Jillian y le explica la situación. Aunque al principio le teme, Jillian llega a aceptar a Jerico al verle estrechar lazos con su hija, Emma, y le permite pasar la noche con ella. A la mañana siguiente, Jerico se da cuenta, gracias a una conversación con Jillian, de que la bolsa está escondida en la colección de libros raros de la Universidad de Londres, donde ella trabaja. Intenta recuperar la bolsa, pero es capturado por Heimdahl y Elsa una vez que la ha encontrado. Heimdahl amenaza con matar a Jillian y Emma a menos que Jerico le lleve al Holandés.

Con la CIA y un equipo de asalto ruso buscando ahora al Holandés, Jerico -que ha recordado que Pope escondió al Holandés en el despacho de Jillian en la universidad- consigue escapar de Elsa utilizando una bomba improvisada de nitroglicerina, volviendo al despacho para dar una explicación apresurada al Holandés. Elsa les encuentra antes de que puedan escapar, dispara a Jerico en el hombro y mata al Holandés, pero Jerico consigue imponerse y la mata a golpes con una lámpara.

Jerico roba una ambulancia y lleva el pendrive que contiene el programa del agujero de gusano al aeródromo donde Heimdahl intenta escapar. Jerico salva a Jillian y Emma, mientras Heimdahl le dispara. Mientras el avión de Heimdahl despega, Jerico revela a Wells que hizo que el Holandés reprogramara el agujero de gusano para que apuntara a la fuente de la siguiente transmisión. Esto provoca que Heimdahl destruya involuntariamente su propio avión cuando intenta disparar un misil contra el aeródromo.

Unos meses más tarde, Jerico aparece en la playa donde Pope y Jillian pasaron su luna de miel. Al principio no responde a nada más que a reflejos y respuestas automáticas. Agotadas todas las demás opciones, Wells y Franks llevan a Jillian y Emma a verle. La visión de la familia de Pope confirma que alguna parte de Pope existe en Jerico, ya que responde con un golpecito en la nariz. Esta era la forma que tenían Pope y Jillian de decirse "te quiero". Al ver esto, Quaker reflexiona que le ofrecerá un trabajo a Jerico.