Tras el espeluznante suicidio del embajador de EE.UU. en el Reino Unido, Damien Thorn, CEO de un conglomerado internacional de 33 años, es nombrado en su lugar, un cargo que su padre adoptivo, Robert Thorn, ocupó en su día. Habiendo aceptado plenamente su linaje impío y habiendo dirigido su empresa durante siete años, Damien intenta ahora remodelar su destino deteniendo la Segunda Venida de Cristo.

Sin embargo, el Padre DeCarlo, un sacerdote del monasterio de Subiaco donde el Padre Spiletto pasó sus últimos días y que ha observado a Damien desde lejos desde la muerte de su padre adoptivo, adquiere las Siete Dagas de Megido que fueron desenterradas de las ruinas del Museo Thorn en Chicago tras el incendio al final de la segunda película. Acompañado por otros seis sacerdotes, DeCarlo planea matar a Damien mientras busca al niño Cristo. Mientras tanto, Damien se involucra románticamente con la periodista Kate Reynolds. Al enterarse de sus asesinos y matar a todos excepto a DeCarlo con el tiempo, procede a moldear al joven hijo de Reynolds, Peter, en un discípulo, aprovechando el deseo del niño de tener una figura paterna.

La segunda estrella de Belén

Tras la alineación de estrellas en la constelación de Casiopea el 24 de marzo de 1981, generando lo que se describe como una segunda Estrella de Belén, Damien se da cuenta de que es una señal de la Segunda Venida y ordena a sus seguidores matar a todos los niños nacidos en Inglaterra la mañana del 24 de marzo de 1981 para evitar el regreso de Cristo al poder. Una semana después de una serie de 31 muertes infantiles, Reynolds se encuentra con DeCarlo y él le revela la verdadera identidad de Damien mientras le da pruebas de los asesinatos. A la mañana siguiente, ella descubre la marca de nacimiento de Damien.

Damien le dice a Peter que siga a DeCarlo, lo que resulta en que Damien se entere de que su asesor, Harvey Dean, había ocultado la fecha de nacimiento de su hijo cuando Peter informa que DeCarlo visitó a la esposa de Dean, Barbara, y le reveló el papel de su marido en los asesinatos de los bebés. Dean se niega a matar a su hijo y hace preparativos para huir del país, sólo para regresar a casa y ser asesinado por su esposa, quien acaba de matar a su hijo con una plancha ardiente bajo la influencia demoníaca de Damien.

La influencia de damien

DeCarlo visita más tarde a Reynolds y le revela que Peter ahora está bajo la influencia de Damien y que el verdadero niño Cristo ahora está fuera del alcance de Damien. Aceptando ayudar a DeCarlo, Reynolds engaña a Damien con la promesa de llevarlo a las ruinas de la iglesia donde está el niño Cristo a cambio de Peter. El plan fracasa cuando Damien ve primero a DeCarlo y usa a Peter como escudo humano contra la daga. Mientras Peter muere en brazos de su madre, Damien estrangula al Padre DeCarlo antes de llamar a Cristo para que se presente ante él y "lo enfrente". Esto deja a Damien abierto a ser apuñalado por detrás por Reynolds usando la daga Megido de DeCarlo.

Mientras Damien tambalea por el patio y se derrumba, Cristo aparece en el arco sobre él. Damien se burla de Cristo pensando que ha ganado, y luego muere mientras Cristo lo destruye. DeCarlo reaparece llevando el cuerpo de Peter y se lo entrega a una Kate rezando. Al salir de las ruinas, se muestran pasajes bíblicos en pantalla.