El teniente Peter Nicholas se enfrenta a un francotirador en la cima de una torre de agua de la ciudad de Nueva York después de haber asesinado a varios peatones al azar. El francotirador le dice a Peter que "Dios me lo dijo" antes de saltar a su muerte. Peter no puede explicar la extraña puntería del francotirador, a pesar de usar un rifle no calibrado de pedido por correo.

Debido a sus creencias católicas, Peter sigue casado, aunque se queda con su novia. Devoto de su fe, asiste a misa todos los días.

Peter visita a un hombre en el hospital que apuñaló a gente al azar en un supermercado. Este hombre hace la misma afirmación sobre Dios que el francotirador antes de morir frente a Peter.

Un hombre con traje de negocios llama por teléfono para avisar de que habrá otro alboroto en el desfile del día de San Patricio, y el autor será un policía. Peter intenta detener el desfile, pero un oficial se las arregla para hacer varios disparos antes de ser derribado. Peter entrevista a otro policía que viajó en el metro con el oficial poseído y se entera de que el oficial habló con un joven de pelo largo y rubio mientras se dirigía al desfile. Entrevistas con la madre del francotirador, un tendero y un portero corroboran la descripción de este misterioso hombre de pelo rubio visto con cada perpetrador. Añaden que también estaba descalzo y tenía la cara borrosa que nadie puede describir con claridad.

Peter finalmente identifica al hombre misterioso como Bernard Phillips. Intenta entrevistar a la madre de Bernard, pero ella muere mientras ataca a Peter. El forense revela que la Sra. Phillips era virgen. Su obstetra añade que Bernard era andrógino.

Peter ataca furiosamente a un hombre que asesinó a su propia familia, supuestamente por orden de Dios. Después de hablar con un policía veterano sobre los asesinatos de Dios, Peter es conducido a un hombre que recogió a la Sra. Phillips 24 años antes en 1951 cuando fue encontrada desnuda caminando por un camino. Ella le contó a este hombre una historia sobre ser secuestrada por un OVNI y quedar embarazada.

Mientras la policía entrevista a su novia, Peter filtra la historia de los asesinatos inspirados por Dios a un periodista, incitando a la histeria en la ciudad. Mientras tanto, un proxeneta traficante de drogas asesina a un policía corrupto, y Peter sospecha que no está relacionado con Dios.

En un edificio de gran altura, un grupo de ejecutivos de Wall Street organizan una reunión secreta sobre el hombre al que sirven y creen que es el Señor, Bernard Phillips. El informante anónimo de antes sugiere que Peter debería unirse a su conspiración. Se revela que Bernard tiene la capacidad de usar su voluntad para que la gente lleve a cabo sus órdenes. Peter se reúne con el líder del grupo, el Sr. Richards, pero muere repentinamente cuando su discusión se centra en los orígenes de Bernard.

Peter se va apresuradamente pero es capaz de capturar al informante cuando intenta empujar al teniente frente a un tren subterráneo. Obliga a este hombre a llevarlo a conocer a Bernard. Peter es bajado en un ascensor a la sala de la caldera porque a Bernard le gusta el calor y nunca sale del edificio. Cumplido su propósito, el informante cae muerto en el ascensor en cuanto deja a Peter.

Peter se da cuenta de que Bernard le tiene miedo y que tampoco puede hacerle daño. Peter se da cuenta de que él es diferente de alguna manera y entonces el edificio se incendia. Peter se escapa y visita el orfanato de donde fue adoptado, descubriendo que su madre es Elizabeth Mullin. La rastrea hasta un asilo y ella cuenta una historia similar a la de la Sra. Phillips acerca de ser secuestrada por un OVNI y tener un nacimiento virgen. Asustada cuando se da cuenta de quién es, obliga a Peter a huir de su habitación.

La novia de Peter visita a su esposa y se entera de que ella tuvo tres abortos en el curso de su matrimonio. La esposa de Peter también tenía la sensación de que él no quería tener hijos. Peter los visita para encontrarlos a ambos y se despide de las dos mujeres que ama.

En un salón de billar, Peter se enfrenta a Zero, el proxeneta asesino de policías de antes, y psíquicamente le quiere matar a sus secuaces y luego a sí mismo. Ahora, listo para la confrontación final, Peter vuelve con Bernard. Bernard revela que la razón por la que Peter es su antítesis es porque Peter no resultó como sus creadores alienígenas pretendían. Así que lo intentaron de nuevo y crearon a Bernard. Bernard ejemplifica sus genes mientras que Peter está más dominado por su lado humano. Peter sabía subconscientemente que sus propios hijos resultarían como Bernard y por lo tanto quería que murieran en el útero. Bernard dice que quiere crear una nueva especie con Peter y revela lo que parece ser un órgano íntimo femenino en el lado de su torso. Peter comienza a estrangular a Bernard y luego saca su arma, pero el edificio se cae a su alrededor. Peter escapa, pero es capturado y sentenciado a un asilo para criminales dementes. Cuando un reportero le pregunta por qué mató a Bernard, Peter responde: "Dios me dijo que lo hiciera".