En 1990, diecisiete años después del exorcismo de Regan MacNeil en 1973, el padre Dyer (Ed Flanders) y el teniente William F. Kinderman (George C. Scott) recuerdan al padre Damien Karras. La noche siguiente, se produce un incidente en una iglesia que indica la presencia de una entidad sobrenatural maligna, que hace que un crucifijo cobre vida. La siguiente escena sigue con la perspectiva de un hombre que camina por las calles y que habla de un sueño en el que "cae por un largo tramo de escaleras", lo que sugiere que alguien está cometiendo asesinatos relacionados con la muerte de Karras.

A la mañana siguiente, Kinderman es llamado para encontrar el cuerpo de Thomas Kintry, un joven negro. Las huellas dactilares en las escenas del crimen no coinciden, lo que indica que una persona diferente fue responsable de cada asesinato. Kinderman revela al personal del hospital que los asesinatos encajan con el modus operandi de James Venamun (Brad Dourif), o "El asesino de Géminis", un asesino en serie que fue ejecutado quince años antes.

Kinderman visita al jefe de un pabellón psiquiátrico, el Dr. Temple (Scott Wilson), que le cuenta la historia de uno de sus pacientes. El paciente fue encontrado vagando sin rumbo quince años antes con amnesia. Estuvo encerrado, catatónico, hasta que se volvió violento y afirmó ser el Asesino de Géminis. Kinderman ve que el paciente es su viejo amigo Damien Karras (Jason Miller). La forma de Karras parece cambiar brevemente a la del Asesino Géminis. Expresa su desconocimiento de Karras pero se jacta de haber matado al Padre Dyer.

Esa noche, una enfermera es asesinada y el Dr. Temple se suicida. Kinderman vuelve a ver a Karras, que vuelve a transformarse en el Asesino Géminis. El Géminis explica que está siendo ayudado por un "Maestro", la misma entidad que había poseído anteriormente a Regan MacNeil. El "Amo" estaba furioso por haber sido exorcizado por Karras, y se está vengando utilizando el cuerpo de Karras como un conducto para que Géminis continúe con su ola de asesinatos. Cada noche, el alma de Géminis abandona el cuerpo de Karras y posee a los demás pacientes en cualquier lugar del hospital, utilizándolos para cometer los asesinatos. El Géminis también revela que ha obligado al Dr. Temple a traer a Kinderman.

El Géminis posee a una anciana e intenta asesinar a Kinderman y a su familia en su casa, pero el ataque termina abruptamente cuando el Padre Paul Morning (Nicol Williamson) llega al hospital y comienza a realizar un exorcismo a Karras. El "Maestro" interviene, apoderándose del cuerpo de Karras, y Morning queda gravemente mutilado. Kinderman vuelve corriendo al hospital e intenta aplicar la eutanasia a Karras. El poseído Karras atormenta e intenta matar a Kinderman. Morning consigue recuperar la conciencia y le dice a Karras que luche. Karras recupera brevemente su libre albedrío y grita a Kinderman que dispare, matando a Karras y liberándolo tanto de los Géminis como de su "Amo". Más tarde, Kinderman asiste al funeral de Karras. El año de la muerte de Karras figura como 1975 en su lápida.