En 1979, el Papa envía a un sacerdote en una misión para proteger a una recién nacida, Christine York, identificada en la ciudad de Nueva York por los satanistas como la elegida para ser la madre del hijo de Satanás después de presenciar un cometa que se arquea sobre la luna en el Vaticano. Sin embargo, algunos caballeros del Vaticano (dirigidos por un cardenal corrupto) insisten en que hay que matarla.

En 1999, Satanás posee a un banquero de inversiones en un restaurante antes de destruir el restaurante y a las personas que están dentro. El ex detective de policía Jericho Cane, suicida y alcohólico, deprimido desde los asesinatos por encargo de su mujer e hija, trabaja para una empresa de seguridad privada y culpa a Dios de su situación. Jericho y su compañero de trabajo Bobby Chicago son asignados para proteger al banquero poseído. Un sacerdote, Tomás de Aquino (presumiblemente llamado así por Santo Tomás de Aquino) no consigue matar al banquero. Jericó captura a Aquino, quien le dice a Jericó: "Los mil años han terminado, el ángel oscuro se ha liberado de su prisión" y dice que una mujer es central. A continuación, Aquino es detenido por el Departamento de Policía de Nueva York. Marge Francis, una detective de la policía de Nueva York y antigua colega de Jericho, le dice a éste que Aquino no tiene lengua.

Jericho y Bobby investigan el apartamento de Aquino, donde encuentran su lengua en un frasco y mensajes y símbolos escritos con sangre en las paredes. Marge llega y revela que Aquino fue entrenado por el Vaticano y enviado a Nueva York antes de desaparecer. Jericó interroga al padre Kovak, un sacerdote que conoció a Aquino. Kovak dice que Aquino fue enloquecido por fuerzas que Jericó no podía entender. Satanás entra en el hospital de Aquino y lo crucifica en el techo. Tras ser derribado y dado por muerto, Aquino se despierta, coge una jeringuilla para atacar a Jericó, pero uno de los policías le dispara. Jericho y Chicago leen en latín "Cristo en Nueva York" grabado en la piel de Aquino; comienzan a buscar algún nombre similar y se encuentran con Christine York en su apartamento.

Jericó y Chicago la rescatan de ser asesinada por los caballeros del Vaticano. Sin embargo, Satanás hace estallar la furgoneta de Chicago, matándolo y haciendo arder el apartamento. Jericho lucha contra Mabel, y él y Christine huyen del apartamento en llamas. Satanás mata a Mabel por su fracaso; Marge y otro oficial, ambos revelados como satanistas, exigen a Jericó que entregue a Christine. Jericó finge la rendición antes de matarlos a ambos y escapa con Christine, mientras Satán resucita a Marge para reunir a los demás satanistas para que cumplan sus órdenes. Al refugiarse en la iglesia, el padre Kovak les dice a Jericó y a Christine que Satanás debe fecundarla antes de la medianoche de Año Nuevo para dar paso al "fin de los días". A pesar del escepticismo de Jericó, Christine acepta la protección de Kovak y Jericó vuelve a su apartamento.

Satanás se enfrenta a Jericó en su apartamento e intenta tentarlo para que entregue a Christine a cambio de resucitar a su familia muerta. Después de que Jericó se resista a sus tentaciones, Chicago llama a la puerta de su apartamento poco después. Escéptico de sus afirmaciones de supervivencia, Jericó dispara a Chicago en el brazo para comprobar si Satanás ha poseído el cuerpo de Chicago. Satisfecho de que efectivamente es Chicago, los dos acuerdan recuperar a Christine de la iglesia.

De vuelta a la iglesia, Jericó impide que el cardenal y sus caballeros maten a Christine. Satanás reaparece y mata al clero del Vaticano. Chicago traiciona a Jericó, dejando que sea golpeado y crucificado por una turba de satanistas, revelando que hizo un pacto con Satanás, quien lo resucitó después de que la camioneta explotara. Después de que Chicago se vaya con Christine, Kovak encuentra y rescata a Jericó. Tras su recuperación, Jericó sigue la pista de los satanistas hasta su guarida. Jericho mata a Marge una vez más y rescata a Christine después de convencer a Chicago de que se resista a la influencia de Satanás, sólo para que Satanás queme a Chicago hasta la muerte por romper su pacto. Jericho destruye la guarida con una granada mientras él y Christine escapan a un túnel del metro y suben a un tren. Satanás les sigue en el tren, matando al conductor. Jericho, sin embargo, separa el tren en dos antes de disparar otra granada a Satanás, destruyendo el vagón en el que éste se encontraba. Con el cuerpo del banquero ahora irremediablemente dañado, Satanás abandona a su anfitrión para perseguir a Jericó y a Christine, dejando que el banquero muera.

Mientras huyen, Jericó y Christine llegan a otra iglesia, donde él renueva su fe en Dios y reza para obtener fuerza. Satanás como una enorme criatura alada emerge debajo de la iglesia para poseer a Jericó. Satanás, ahora en el cuerpo de Jericó, intenta violar a Christine, pero Jericó, respondiendo a las súplicas de Christine, es capaz de resistirse a Satanás el tiempo suficiente para empalarse deliberadamente en una espada que sobresale de una estatua del arcángel Miguel, sacrificándose para evitar el fin de Satanás. Al filo de la medianoche, Dios libera a Jericó y envía a Satanás de vuelta al infierno mientras el mundo celebra un nuevo milenio. Jericó ve a su mujer y a su hija esperándole en el más allá. Jericó muere en paz, y Christine lo abraza entre lágrimas antes de que la policía y la ambulancia lleguen para llevarse el cuerpo de Jericó.