Mientras hacía el ensayo para su inminente boda La Novia, que así conocemos a la protagonista durante la mayor parte de la saga, es atacada por sus antiguos compañeros. En el combate mueren todos los acompañantes de la protagonista y a ella le disparan una bala en la cabeza que la deja en coma de manera indefinida. El responsable ha sido Bill, el exjefe y amante de La Novia, que además, en la refriega, asesina a la hija nonata de ambos.

Tiempo después La Novia sale del coma y decide vengarse de todos los que estuvieron en la citada matanza. Uno por uno irá acabando con todos hasta llegar a Bill.

Tras acabar con Vernita Green, Go Go Yubari y toneladas de soldados japoneses, La Novia se enfrenta en combate contra O-Ren en un jardín nevado puramente nipón. Si bien la habilidad de la yakuza es alta, La Novia cuenta con la mejor espada fabricada por el legendario Hattori Hanzô.

El enfrentamiento termina con un potente corte que rebana la cabeza de O-Ren sin piedad. Pero el trabajo de La Novia en Japón todavía no ha terminado. Todavía le queda finiquitar la tarea con Fatale, que tras ser torturada acaba ingresada en un hospital. Allí le visita Bill, revelándole una inesperada noticia: la hija de La Novia está vivita y coleando. En otro lugar, La Novia actualiza su lista negra y se prepara para adentrarse en el siguiente capítulo de su sangrienta historia.