En 1987, un año después de los acontecimientos de la película anterior, la adolescente Kristen Parker sueña que Freddy Krueger la persigue. La ataca en su cuarto de baño cuando ella cree que ya se ha despertado, haciendo que parezca que se ha cortado la muñeca en el mundo real.

Creyendo que Kristen es una suicida, su madre la ingresa en el Hospital Psiquiátrico Westin Hills, donde es puesta bajo el cuidado del Dr. Neil Gordon. En el hospital, Kristen lucha contra los camilleros que intentan sedarla porque teme quedarse dormida. La nueva terapeuta interna, Nancy Thompson, la calma y se hace amiga de ella recitando parte de la canción infantil de Freddy. Nancy es presentada al resto de los pacientes del Dr. Gordon: Phillip, un sonámbulo habitual; Kincaid, un chico duro de la calle propenso a la violencia; Jennifer, una aspirante a actriz de televisión propensa a las quemaduras de cigarrillos; Will, que utiliza una silla de ruedas debido a un intento de suicidio anterior; Taryn, una drogadicta en recuperación; y Joey, el más joven, que está demasiado traumatizado para hablar. Una noche, Freddy ataca a Kristen en sus sueños, pero ella, sin saberlo, arrastra a Nancy a su sueño, lo que les permite escapar.

Kristen revela que ha sido capaz de atraer a la gente a sus sueños desde que era joven. Durante las dos noches siguientes, Freddy lanza a Phillip desde un tejado y mata a Jennifer estrellando su cabeza contra un televisor. En la siguiente sesión de grupo, Nancy revela a los demás pacientes que son "los últimos niños de la calle Elm", los hijos supervivientes de los que se unieron y quemaron a Krueger hasta la muerte hace muchos años. Tanto Nancy como Neil les animan a probar la hipnosis de grupo para que puedan experimentar un sueño compartido y descubrir sus poderes oníricos. En el sueño, Joey se aleja y es capturado por Freddy, dejándolo en coma en el mundo real; Nancy y Neil son relevados. Una monja, la hermana Mary Helena, le dice a Neil que Freddy es el hijo de una joven del personal del hospital que fue encerrada accidentalmente en una habitación con cientos de enfermos mentales que la violaban continuamente, y que la única forma de detenerlo es dar con sus huesos.

Él y Nancy preguntan a su padre, el oficial Donald Thompson, dónde están escondidos los huesos, pero éste se muestra poco cooperativo. Nancy vuelve corriendo al hospital cuando se entera de que Kristen ha sido sedada. Neil se queda para convencer a Donald de que les ayude. Nancy y los demás vuelven a realizar una hipnosis de grupo para reunirse con Kristen, pero todos son separados por Freddy. Taryn y Will son asesinados por Freddy mientras Kristen, Nancy y Kincaid se encuentran. El trío rescata a Joey pero son incapaces de derrotar a Freddy porque se ha vuelto demasiado poderoso debido a las almas que ha absorbido. Al sentir que sus restos han sido encontrados, Freddy se apropia de su propio esqueleto y mata a Donald antes de incapacitar a Neil. Freddy vuelve a atacar a los demás pero Joey utiliza su voz de poder onírico para repelerlo. Donald le dice a Nancy que está cruzando pero se revela como Freddy y Nancy lo empuja, antes de que pueda matarla. Freddy abofetea a Nancy que cae al suelo. Freddy, creyendo que Nancy está muerta, se acerca a Kristen para matarla pero una Nancy aún viva le apuñala con su propio guante. Neil logra recuperarse y purifica los huesos de Freddy, matándolo. Tras la muerte de Nancy, Kristen consigue despertar a todos y devolverlos al mundo real. Durante el funeral de los pacientes, Neil encuentra la lápida de Amanda Krueger y descubre que es la hermana Mary Helena. Esa noche, se va a dormir con la muñeca malaya que Nancy le regaló y la casa de papel maché de Kristen cerca, y de repente la casa de Kristen se ilumina por dentro, sugiriendo que Freddy no está completamente derrotado.