En 1969, los estudiantes Martin Brice y Cosmo son piratas informáticos que utilizan sus habilidades para financiar organizaciones de izquierda. Cuando Martin se va a por una pizza, Cosmo es detenido, lo que obliga a Martin a convertirse en fugitivo.

En el San Francisco actual, Martin, ahora llamado Martin Bishop, dirige un equipo de especialistas en seguridad que realiza pruebas de penetración. El equipo incluye a Donald Crease, un antiguo oficial de la CIA y hombre de familia; Darren "Mother" Roskow, un teórico de la conspiración y técnico en electrónica; Carl Arbogast, un joven genio de la piratería informática; e Irwin "Whistler" Emery, un pirata telefónico ciego.

Tras prestar sus servicios a un banco, Martin es abordado por los agentes de la NSA Dick Gordon y Buddy Wallace. Le piden que recupere una "caja negra" del matemático Dr. Gunter Janek, desarrollada bajo el nombre de "Setec Astronomy" supuestamente para el gobierno ruso. Martin duda, pero acepta cuando los agentes le revelan que conocen su verdadera identidad y le ofrecen limpiar su pasado a cambio. Con la ayuda de su antigua novia, Liz, Martin y su equipo aseguran la caja, que está disfrazada de contestador telefónico. Durante su posterior fiesta de celebración, Whistler, Madre y Carl investigan la caja, descubriendo que es capaz de romper la encriptación de casi todos los sistemas informáticos. Martin descubre que "Setec Astronomy" es un anagrama de "too many secrets" (demasiados secretos), y decreta un bloqueo hasta que puedan entregar la caja al día siguiente.

Martin entrega la caja a Gordon y Wallace, pero apenas se salva de ser asesinado por ellos después de que Crease descubra que Janek fue asesinado la noche anterior. Su amigo, Gregor, en el consulado ruso, confirma que los oficiales eran agentes deshonestos y que Janek trabajaba para la NSA. Antes de que Gregor pueda dar más detalles, unos falsos agentes del FBI lo matan y secuestran a Martin, llevándolo a un lugar remoto donde se reúne con Cosmo, a quien Martin creía muerto en prisión. Mientras estaba encarcelado, Cosmo desarrolló vínculos con el crimen organizado, que reconoció su talento y más tarde lo instaló como su blanqueador de dinero y pagador. Cosmo planea utilizar la caja de Janek para desestabilizar la economía mundial y ofrece a Martin la posibilidad de unirse a él. Martin se niega, por lo que Cosmo utiliza la caja para entrar en el ordenador central del FBI y conectar la identidad actual de Martin con su antiguo nombre. Cosmo hace que Martin sea noqueado y llevado de vuelta a la ciudad.

Martin, ahora de nuevo fugitivo de la ley, traslada a su equipo al apartamento de Liz. Se ponen en contacto con el agente de la NSA Abbott, que quiere la caja pero no puede ofrecer seguridad hasta que esté en posesión de Martin. Whistler analiza los sonidos que Martin escuchó durante su secuestro y puede identificar la zona geográfica donde fue secuestrado Martin, una empresa de juguetes que actúa como fachada de la operación de Cosmo. Investigan los sistemas de seguridad del edificio e identifican a Werner Brandes, un empleado cuya oficina está al lado de la de Cosmo. Le organizan a Liz una falsa cita por ordenador con Brandes para obtener su tarjeta de acceso y sus códigos de reconocimiento vocal, que Martin y los demás miembros del equipo utilizan para iniciar la recuperación de la caja.

Brandes empieza a sospechar de Liz durante la cita y la lleva a Cosmo a su oficina. No parece haber nada raro, y Cosmo deja que Liz se vaya, pero cuando ella comenta que se trata de una cita por ordenador, Cosmo reconoce el trabajo de Martin y bloquea las instalaciones. Martin es detenido y Cosmo vuelve a intentar convencerle de que se una a él. Martin se niega y en su lugar entrega la caja. El equipo escapa antes de que Cosmo se dé cuenta de que tiene un duplicado vacío.

De vuelta a sus propias oficinas, el equipo de Martin es rodeado por Abbott y sus agentes. Después de que Martin señale lo importante que es el secreto de la caja para la NSA, que podría utilizarla para espiar a otras agencias, Abbott accede a limpiar el expediente de Martin y a conceder las peticiones del resto de su equipo. Después de que Abbott y los agentes se marchen con la caja, Martin demuestra que ha inutilizado la caja eliminando el procesador principal.

En un epílogo, una noticia describe la repentina quiebra del Comité Nacional Republicano y la recepción simultánea de grandes donaciones anónimas a Amnistía Internacional, Greenpeace y el United Negro College Fund.