Kara Zor-El, prima de Kal-El/Superman y sobrina de Jor-El, vive en Argo City, una comunidad kryptoniana aislada que sobrevivió a la destrucción del planeta al ser transportada a una bolsa de espacio transdimensional, la Zona de Supervivencia. Un hombre llamado Zaltar permite a Kara ver un objeto único e inmensamente poderoso conocido como el Omegahedron, que ha tomado prestado sin el conocimiento del gobierno de la ciudad, y que da energía a la ciudad. Sin embargo, un percance hace que el Omegahedron salga disparado al espacio. Tomando una nave, Kara lo sigue hasta la Tierra (sufriendo una transformación en "Supergirl" en el proceso) para recuperarlo y salvar la ciudad.

En la Tierra, el Omegaedro es recuperado por Selena, una aspirante a bruja ávida de poder, ayudada por la irresponsable Bianca, que busca liberarse de su relación con el hechicero Nigel. Aunque no sabe exactamente lo que es, Selena no tarda en darse cuenta de que el Omegahedron es poderoso y puede proporcionarle verdadera magia. Supergirl llega a la Tierra y recibe nuevos poderes gracias a su entorno y a la radiación de su sol. Mientras busca el Omegahedron, crea la identidad encubierta de Linda Lee, prima de Clark Kent, y se inscribe en una escuela para chicas donde se hace amiga de Lucy Lane, la hermana menor de Lois Lane que resulta estar estudiando allí. Supergirl también conoce y se enamora de Ethan, un jardinero de la escuela.

Ethan también llama la atención de Selena, que lo droga con una poción de amor que hará que se enamore de la primera persona que vea durante un día. Ethan recupera la conciencia en ausencia de Selena y sale a la calle. Una enfadada Selena utiliza sus nuevos poderes para animar un vehículo de construcción para recuperar a Ethan, provocando el caos mientras lo hace. Supergirl, bajo la apariencia de Linda, rescata a Ethan y éste se enamora de ella.

Supergirl y Selena se enfrentan. Selena captura a Ethan, luego atrapa a Supergirl y la envía a la Zona Fantasma, una dimensión de prisión. Ahora sin poder, Supergirl vaga por el sombrío paisaje y finalmente se encuentra con Zaltar, que se ha exiliado a la Zona Fantasma como castigo por haber perdido el Omegahedron. Zaltar ayuda a Kara a escapar, sacrificando su vida para ello. De vuelta a la Tierra, Selena utiliza el Omegahedron para convertirse en "princesa de la Tierra" con Ethan como amante y consorte.

Al salir de la Zona Fantasma a través de un espejo, Supergirl recupera sus poderes y se enfrenta a Selena, que utiliza el Omegahedron para convocar a un gigantesco demonio de las sombras. El demonio está a punto de derrotar a Supergirl cuando escucha la voz de Zaltar instándola a seguir luchando. Supergirl se libera y Nigel le dice que la única forma de derrotar a Selena es volver al demonio contra ella. Supergirl accede y crea un torbellino que atrapa a Selena, que es atacada e incapacitada por el demonio mientras el torbellino atrae también a Bianca. Los tres son succionados a través del portal del espejo, que rápidamente se reforma, atrapándolos a todos para siempre. Libre del hechizo de Selena, Ethan admite su amor por Linda, sabiendo que ella y Supergirl son la misma cosa. También entiende que ella debe salvar Argo City y que puede que no la vuelva a ver. La escena final muestra a Kara devolviendo el Omegahedron a una oscura Argo City, que vuelve a iluminarse.