Taki viaja a Itomori, y encuentra el santuario de la familia de Mitsuha, todavía intacto. Entra dentro y encuentra el sake que Mitsuha y su hermana dejaron. Taki piensa que si bebe algo de su sake, puede hacer una última conexión y quizás salvarla.

Taki bebe un poco, pero cuando se levanta, se tropieza y cae. Mientras lo hace, ve toda la vida de Mitsuha; su nacimiento, la felicidad con sus padres, el nacimiento de su hermana, la enfermedad y la muerte de su madre, el abandono de la familia por parte de su padre, la abuela que las cuida y la muerte por el cometa.

Taki se despierta en el cuerpo de Mitsuha. Se da cuenta de que tiene una última oportunidad. Al ver la televisión, se da cuenta de que es el día del cometa y la destrucción de la ciudad. Al tratar de hablar conla abuela, Hitoha se da cuenta de que alguien más vive en su nieta, ya que ella le pasó un fenómeno similar cuando era más joven. Taki (como Mitsuha) le cuenta a Hitoha lo de el cometa pero le dice que nadie los creerá.

Sin inmutarse, Taki encuentra a los amigos de Mitsuha, Katsuhiko y Sayaka, y les dice lo que sucederá. A pesar de dudar de lo que les dijeron, creen en ella lo suficiente como para ayudarla. Hacen un plan para intentar salvar la ciudad.

Taki va con el padre de Mitsuha, pero todo lo que el hombre puede ver es que su hija se ha vuelto loca y le ordena que vea a un médico. Enfurecido, Taki lo agarra por la corbata y grita: "Hijo de un ...", pero ambos se detienen. "¿Quién eres?", Pregunta el padre de Mitsuha, al darse cuenta que su hija no está frente a él. Sin embargo, la advertencia cae en saco roto. Taki, pensando que su cuerpo con Mitsuha adentro está cerca del Santuario, corre hasta allí para encontrarse con ella.

Mientras tanto, Mitsuha se despierta en el cuerpo de Taki en el presente y ve la ciudad destruida. "¿Eso significa que morí?", Pregunta.

Mitsuha recuerda el día que fue a Tokio, esperando conocer a Taki, pensando que, aunque técnicamente eran extraños, si se conocieran conocerían su conexión. Por casualidad ella lo encontró en el tren, aunque él no la reconoció (ya que su conexión solo comenzaría 3 años después de su muerte). Con el corazón roto, deja el tren, pero Taki siente algo y la llama. Ella le pide que recuerde su nombre. Ella fue quien le dio el lazo del pelo y así los unió.

Taki y Mitsuha finalmente están en el santuario, pero no pueden verse el uno al otro, separados por el tiempo. Sin embargo, durante la "Hora Mágica" en un cierto lugar, finalmente pueden verse y encontrarse por primera vez. Taki devuelve su lazo y se ata el pelo. Taki sugiere que se escriban nombres en sus manos para que no los olviden. Taki escribe el suyo, pero cuando ella escribe su nombre, la conexión se rompe.

Taki se despierta, de vuelta en su cuerpo, en las afueras del todavía destruido Itomori. No puede recordar por qué fue allí, ni el nombre de una niña que lo persigue. Él se dirige a casa a Tokio.

De vuelta en el pasado, Mitsuha, sabiendo lo que sucederá promulga su plan con sus amigos. Explotan la red eléctrica con explosivos, activando la energía de emergencia. Sayaka le cuenta a toda la ciudad la historia de los incendios forestales para llevar a la gente a la escuela. Aunque algunos prestan atención a la advertencia, no hay suficiente gente. Además, el alcalde está tratando de descubrir quién está enviando esta advertencia "falsa". Finalmente, atrapan a Sayaka y la alerta se apaga. Katsuhiko le dice a Mitsuha que a menos que sea capaz de convencer a su padre, todo está perdido.

Mitsuha comienza a correr, pero se desanima cada vez más ya que no puede recordar el nombre de Taki. Ella tropieza y cae, mirándose la mano. Ella ve que Taki, en lugar de escribir su nombre, escribió "TE AMO" en su lugar. Sorprendida y llorando, sigue corriendo, antes de reunirse con su padre en un edificio.

El fragmento del cometa golpea la ciudad, destruyéndola.

5 AÑOS DESPUÉS:

Taki se graduó de la escuela secundaria y la universidad, y ahora está buscando trabajo como arquitecto. Sin embargo, sus puntos de vista apasionados e idealistas sobre la preservación de las ciudades en caso de desastres lo hacen parecer tonto ante los entrevistadores, lo que lo lleva a obtener pocas o ninguna oferta.

Taki recibe una llamada de la Sra. Okudera, pidiendo encontrarse. Se ponen al día, y ella menciona el día que fueron a Itomori. Taki dice que no recuerda mucho de ese día o por qué estuvo tan obsesionado con la ciudad. Resulta que la realidad ha cambiado. Mitsuha fue capaz de convencer a su padre del peligro. Que además de su atrevido plan, llevó a toda la ciudad a ser evacuada a un área fuera del radio de explosión. La ciudad fue diezmada, pero nadie murió. Aún así, Taki no tiene idea de su conexión para evitar la tragedia o de la chica a la que ayudó a salvar.

Mientras se separan, la Sra. Okudera le dice a Taki que espera que algún día encuentre la felicidad. Taki nota lo mismo, aunque se ha sentido como si hubiera pasado años buscándolo, anhelando algo, o más bien alguien.

En un restaurante, escucha un par de discusiones sobre los planes de boda. Vemos que son Sayaka y Katsuhiko, que sobrevivieron gracias a Taki y Mitsuha.

Taki, sin saber por qué, busca en la calle todos los días a una mujer cuyo cabello está atado con un lazo específico.

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En un momento dado, Taki y Mitsuha se cruzan en la calle, pero no miran atrás, decidiendo que sus extraños sentimientos no son nada.

Un día, finalmente, se ven a pocos metros. Aunque no están seguros de por qué, sienten una conexión. Después de bajar, corren por la ciudad, buscándose el uno al otro. Taki ve a una mujer en lo alto de una escalera y pasa junto a ella, mientras camina hacia abajo. Una vez más, sienten una conmoción y casi la ignoran una vez más. Sin embargo, Taki no puede soportarlo más y llama a la mujer. Es Mitsuha. Él pregunta si se han conocido antes. Mitsuha lo mira con lágrimas en los ojos. Ella dice que ella siente lo mismo. Simultáneamente, preguntan "¿Puedo preguntarte tu nombre?"